É por essas e por outras que nem ponho mais clip de bateria nos meus pedais.
Além de ser ambientalmente correto, os clips que encontro à venda são muito vagabundos e, eliminando-os, reposiciono a 3PDT e ganho mais espaço interno

[VOX]

VOX nos pedais com terra positivo eu uso só bateria e tive o mesmo
problema, até sei o que você fez, quer ver como adivinho?

Você deixou um espaço bem justo para a bateria, emprensando entre
a parede da caixa e a 3pdt, e uma quina da bateria impede que
o ressalto arredondado que circula o buraco do parafuso na quina da
tampa encaixe pois fica encostando na bateria, não foi?  :D :D :D

A solução é essa que já foi dita, limar este ressalto arredondado da tampa.

Eu usei uma dremel para nivelar esta parte da tampa, basta apenas limar
o ressalto na parte arredondada da quina da tampa.

E quanto as caixas genéricas que não deram esse problema, talvez você
tenha deixado mais espaço para a bateria entre a parede da caixa e a 3pdt.

Abraços.